SOX6

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Il fattore trascrizionale SOX-6 è una proteina codificata negli esseri umani dal gene SOX6.^[1]^[2]

SOX-6
SOX6 dall'archivio PDB
Gene
HUGO	SOX6 HSSOX6
Entrez	55553
Locus	Chr. 11 [1]
Proteina
OMIM	607257
UniProt	P04637
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La famiglia dei geni SOX codifica per un gruppo di fattori trascrizionali caratterizzati dal dominio HMG (high mobility group), un dominio di legame al DNA. I fattori trascrizionali SOX, a differenza della maggior parte dei fattori trascrizionali, si legano al solco minore del DNA piegando la doppia catena di un angolo di 70-85 gradi e introducendo cambiamenti conformazionali locali.^[2]

Interazioni

È stato dimostrato che SOX6 interagisce con CTBP2^[3] e CENPK.^[4]

Note

^ Cohen-Barak O, Hagiwara N, Arlt MF, Horton JP, Brilliant MH, Cloning, characterization and chromosome mapping of the human SOX6 gene, in Gene, vol. 265, n. 1-2, marzo 2001, pp. 157-64, PMID 11255018.
^ ^a ^b Entrez Gene: SOX6 SRY (sex determining region Y)-box 6, su ncbi.nlm.nih.gov.
^ A Murakami, Ishida S, Thurlow J, Revest J M, Dickson C, SOX6 binds CtBP2 to repress transcription from the Fgf-3 promoter, in Nucleic Acids Res., vol. 29, n. 16, England, agosto 2001, pp. 3347-55, PMID 11504872.
^ A Yamashita, Ito M, Takamatsu N, Shiba T, Characterization of Solt, a novel SoxLZ/Sox6 binding protein expressed in adult mouse testis, in FEBS Lett., vol. 481, n. 2, NETHERLANDS, settembre 2000, pp. 147-51, ISSN 0014-5793 (WC · ACNP), PMID 10996314.

Bibliografia

Denny P, Swift S, Brand N, et al., A conserved family of genes related to the testis determining gene, SRY., in Nucleic Acids Res., vol. 20, n. 11, 1992, p. 2887, DOI:10.1093/nar/20.11.2887, PMID 1614875.
Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B, A new long form of Sox5 (L-Sox5), Sox6 and Sox9 are coexpressed in chondrogenesis and cooperatively activate the type II collagen gene., in Embo J., vol. 17, n. 19, 1998, pp. 5718–33, DOI:10.1093/emboj/17.19.5718, PMID 9755172.
Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA, et al., Sox6 is a candidate gene for p100H myopathy, heart block, and sudden neonatal death., in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 97, n. 8, 2000, pp. 4180–5, DOI:10.1073/pnas.97.8.4180, PMID 10760285.
Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T, Characterization of Solt, a novel SoxLZ/Sox6 binding protein expressed in adult mouse testis., in FEBS Lett., vol. 481, n. 2, 2000, pp. 147–51, DOI:10.1016/S0014-5793(00)01987-6, PMID 10996314.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA, DNA cloning using in vitro site-specific recombination., in Genome Res., vol. 10, n. 11, 2001, pp. 1788–95, DOI:10.1101/gr.143000, PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al., Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs., in Genome Res., vol. 11, n. 3, 2001, pp. 422–35, DOI:10.1101/gr.154701, PMID 11230166.
Murakami A, Ishida S, Thurlow J, et al., SOX6 binds CtBP2 to repress transcription from the Fgf-3 promoter., in Nucleic Acids Res., vol. 29, n. 16, 2001, pp. 3347–55, DOI:10.1093/nar/29.16.3347, PMID 11504872.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al., Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences., in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, n. 26, 2003, pp. 16899–903, DOI:10.1073/pnas.242603899, PMID 12477932.
Cohen-Barak O, Yi Z, Hagiwara N, et al., Sox6 regulation of cardiac myocyte development., in Nucleic Acids Res., vol. 31, n. 20, 2004, pp. 5941–8, DOI:10.1093/nar/gkg807, PMID 14530442.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs., in Nat. Genet., vol. 36, n. 1, 2004, pp. 40–5, DOI:10.1038/ng1285, PMID 14702039.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al., From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline., in Genome Res., vol. 14, 10B, 2004, pp. 2136–44, DOI:10.1101/gr.2576704, PMID 15489336.
Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, et al., Expression of a transcriptional factor, SOX6, in human gliomas., in Brain tumor pathology, vol. 21, n. 1, 2005, pp. 35–8, DOI:10.1007/BF02482175, PMID 15696967.
Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y, et al., Immunohistochemical analysis of SOX6 expression in human brain tumors., in Brain tumor pathology, vol. 21, n. 3, 2005, pp. 117–20, DOI:10.1007/BF02482186, PMID 15696972.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al., The LIFEdb database in 2006., in Nucleic Acids Res., vol. 34, Database issue, 2006, pp. D415–8, DOI:10.1093/nar/gkj139, PMID 16381901.
Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, et al., Repression of SOX6 transcriptional activity by SUMO modification., in FEBS Lett., vol. 580, n. 5, 2006, pp. 1215–21, DOI:10.1016/j.febslet.2006.01.031, PMID 16442531.
Ikeda T, Saito T, Ushita M, et al., Identification and characterization of the human SOX6 promoter., in Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 357, n. 2, 2007, pp. 383–90, DOI:10.1016/j.bbrc.2007.03.133, PMID 17433257.

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