Cathepsine D

CTSD
Structure de la protéine CTSD. Basé sur l'identifiant PDB 1lya.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1LYA, 1LYB, 1LYW, 4OBZ, 4OC6, 4OD9

Identifiants
AliasesCTSD, Cathepsine D
IDs externesOMIM: 116840 MGI: 88562 HomoloGene: 55616 GeneCards: CTSD
Position du gène (Homme)
Chromosome 11 humain
Chr.Chromosome 11 humain[1]
Chromosome 11 humain
Localisation génomique pour CTSD
Localisation génomique pour CTSD
Locus11p15.5Début1,752,752 bp[1]
Fin1,764,573 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour CTSD
Localisation génomique pour CTSD
Locus7|7 F5Début141,929,648 bp[2]
Fin141,941,775 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • right adrenal cortex

  • left adrenal gland

  • left adrenal cortex

  • apex of heart

  • stromal cell of endometrium

  • poumon droit

  • granulocyte

  • upper lobe of left lung

  • vésicule biliaire

  • olfactory zone of nasal mucosa
Fortement exprimé dans
  • choroid plexus of fourth ventricle

  • stroma of bone marrow

  • calvaria

  • granulocyte

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • lèvre

  • œsophage

  • muscle de la cuisse

  • épithélium pigmentaire rétinien

  • ganglion mésentérique
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • activité peptidasique
  • activité hydrolase
  • liaison protéique
  • serine-type endopeptidase activity
  • cysteine-type endopeptidase activity
  • aspartic-type endopeptidase activity
  • aspartic-type peptidase activity
Composant cellulaire
  • lysosomal lumen
  • exosome
  • radeau lipidique
  • matrice extracellulaire
  • lysosome
  • mélanosome
  • milieu extracellulaire
  • specific granule lumen
  • tertiary granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
  • région extracellulaire
  • collagen-containing extracellular matrix
  • lysosomal membrane
  • endosome membrane
Processus biologique
  • protein catabolic process
  • autophagie
  • collagen catabolic process
  • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
  • protéolyse
  • neutrophil degranulation
  • lipoprotein catabolic process
  • positive regulation of apoptotic process
  • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • regulation of establishment of protein localization
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

1509

13033

Ensembl

ENSG00000117984

ENSMUSG00000007891

UniProt

P07339

P18242

RefSeq (mRNA)

NM_001909

NM_009983

RefSeq (protéine)

NP_001900

NP_034113

Localisation (UCSC)Chr 11: 1.75 – 1.76 MbChr 7: 141.93 – 141.94 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La cathepsine D est une protéine appartenant à la famille des cathepsines et qui est encodée par le gène CTSD situé sur le chromosome 11 chez l'humain[5],[6].

Notes et références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Cathepsin D » (voir la liste des auteurs).
  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117984 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000007891 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) P. L. Faust, S. Kornfeld et J. M. Chirgwin, « Cloning and sequence analysis of cDNA for human cathepsin D », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 82, no 15,‎ , p. 4910–4 (PMID 3927292, PMCID 390467, DOI 10.1073/pnas.82.15.4910).
  6. (en) « Entrez Gene: CTSD cathepsin D ».
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