Amalgaviridae

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Amalgaviridae
Description de l'image Defaut 2.svg.
Classification ICTV
Realm Riboviria
Règne Orthornavirae
Embranchement Pisuviricota
Classe Duplopiviricetes
Ordre Durnavirales

Famille

Amalgaviridae
ICTV 2013[1]

Genres de rang inférieur

Selon NCBI (21 décembre 2020)[2] :
  • Amalgavirus
  • Zybavirus

Les Amalgaviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales qui comprend deux genres et dix espèces. Ce sont des virus à ARN à double brin, rattachés au groupe III de la classification Baltimore, qui infectent principalement les plantes (phytovirus), une espèce infectant des champignons (mycovirus).

Étymologie

Le nom de famille « Amalgaviridae » dérive du terme « amalgame », en référence au mélange d'homologies avec les Totiviridae et les Partitiviridae qui caractérise la famille des Amalgaviridae[3], suivi du suffixe -viridae qui caractérise les noms de familles de virus.

Génome

Les virus de la famille des Amalgaviridae ont un génome monopartite d'environ 3,5 kilobases[4],[5]. Il présente deux cadres de lecture ouverts qui se chevauchent partiellement et codent l' ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) et une protéine de capside supposée[4],[6].

Liste des genres et espèces

Selon ICTV[7]  :

  • Amalgavirus
    • Allium cepa amalgavirus 1
    • Allium cepa amalgavirus 2
    • Blueberry latent virus[8]
    • Rhododendron virus A[5]
    • Southern tomato virus (espèce-type)[4]
    • Spinach amalgavirus 1
    • Vicia cryptic virus M[6]
    • Zoostera marina amalgavirus 1
    • Zoostera marina amalgavirus 2
  • Zybavirus
    • Zygosaccharomyces bailii virus Z (espèce-type)

Notes et références

  1. ↑ ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 24 janvier 2021
  2. ↑ NCBI, consulté le 21 décembre 2020
  3. ↑ (en) « Amalgavirus », sur ViralZone (consulté le ).
  4. ↑ a b et c (en) S Sabanadzovic, R. A. Valverde, J. K. Brown, R. R. Martin et I. E. Tzanetakis, « Southern tomato virus: The link between the families Totiviridae and Partitiviridae », Virus Research, vol. 140, nos 1–2,‎ , p. 130–7 (DOI 10.1016/j.virusres.2008.11.018).
  5. ↑ a et b (en) S Sabanadzovic, N Abou Ghanem-Sabanadzovic et R. A. Valverde, « A novel monopartite dsRNA virus from rhododendron », Archives of Virology, vol. 155, no 11,‎ , p. 1859–63 (DOI 10.1007/s00705-010-0770-5).
  6. ↑ a et b (en) W Liu et J Chen, « A double-stranded RNA as the genome of a potential virus infecting Vicia faba », Virus Genes, vol. 39, no 1,‎ , p. 126–31 (DOI 10.1007/s11262-009-0362-1).
  7. ↑ (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », sur ICTV, (consulté le ).
  8. ↑ (en) R. R. Martin, J Zhou et I. E. Tzanetakis, « Blueberry latent virus: An amalgam of the Partitiviridae and Totiviridae », Virus Research, vol. 155, no 1,‎ , p. 175–80 (DOI 10.1016/j.virusres.2010.09.020).

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

  • Amalgaviridae, sur Wikimedia Commons
  • Amalgaviridae, sur Wikispecies
  • (en) Référence ICTV : Amalgaviridae (consulté le )
  • (en) Référence NCBI : Amalgaviridae (taxons inclus) (consulté le )
  • (en) « Amalgaviridae », sur ViralZone (consulté le ).
v · m
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