Mioferlina

MYOF
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

2DMH, 2K2O

Identificadors
ÀliesMYOF, FER1L3, myoferlin, HAE7
IDs externesOMIM: 604603   MGI: 1919192   HomoloGene: 40882   GeneCards: MYOF   OMA: MYOF - orthologs
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 19 (ratolí)
Cr.Cromosoma 19 (ratolí)[1]
Cromosoma 19 (ratolí)
Localització genòmica per MYOF
Localització genòmica per MYOF
Banda19|19 C2Inici37.887.484 bp[1]
Fi38.032.025 bp[1]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • skin of hip

  • gingival epithelium

  • nasal epithelium

  • skin of thigh

  • stromal cell of endometrium

  • mucosa of paranasal sinus

  • epithelium of nasopharynx

  • uretra

  • conjuntiva palpebral

  • decidu
Més explicacions
  • transitional epithelium of urinary bladder

  • stroma of bone marrow

  • decidu

  • sàcul

  • endothelial cell of lymphatic vessel

  • cordó umbilical

  • úter

  • right lung lobe

  • sac vitel·lí

  • calvaria
Més dades d'expressió de referència
BioGPS


Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • unió proteica
  • phospholipid binding
Component cel·lular
  • caveola
  • component integral de la membrana
  • membrana plasmàtica
  • Membrana nuclear
  • exosoma extracel·lular
  • nuclear envelope
  • cytoplasmic vesicle membrane
  • cytoplasmic vesicle
  • intracellular membrane-bounded organelle
  • nucli cel·lular
  • membrana
Procés biològic
  • cellular response to heat
  • plasma membrane repair
  • contracció muscular
  • blood circulation
  • regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
  • myoblast fusion
  • glycerol metabolic process
  • T-tubule organization
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

26509

226101

Ensembl

ENSG00000138119

ENSMUSG00000048612

UniProt

Q9NZM1

Q69ZN7

SeqRef (ARNm)

NM_013451
NM_133337

NM_001099634
NM_001302140
NM_177035

SeqRef (proteïna)

NP_038479
NP_579899

NP_001093104
NP_001289069

Localització (UCSC)n/aChr 19: 37.89 – 38.03 Mb
Cerca a PubMed[2][3]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

La mioferlina és una proteïna que en humans està codificada pel gen MYOF .[4][5][6][7]

Funció

La disferlina i l'otoferlina són proteïnes que es troben en humans que són homòlogues a la mioferlina

Les mutacions de la disferlina, una proteïna associada a la membrana plasmàtica poden causar debilitat muscular que afecta tant els músculs proximals com els distals. La proteïna codificada per aquest gen és una proteïna de membrana de tipus II que és estructuralment similar a la disferlina. És membre de la família dels ferlins i s'associa amb les membranes plasmàtiques i nuclears. La mioferlina conté dominis C2 que tenen un paper en els esdeveniments de fusió de membrana mediats pel calci, cosa que suggereix que pot estar implicat en la regeneració i reparació de la membrana . Myoferlin també conté un domini FerA. S'ha demostrat que els dominis FerA interaccionen amb la membrana, cosa que suggereix que el domini FerA de la mioferlina pot contribuir al mecanisme d'interacció de la membrana de la mioferlina.[8] La mioferlina està sobreexpressada en diversos tipus de càncer, especialment de pàncrees i de mama triple negatiu. La sobreexpressió de la mioferlina s'associa amb la proliferació, la migració i la invasió de cèl·lules canceroses i silenciar el gen de la mioferlina en el càncer de mama triple negatiu pot reduir significativament el creixement del tumor i la progressió metastàtica.[9] S'han trobat dues variants de transcripció que codifiquen diferents isoformes per a aquest gen. S'han detectat altres variants possibles, però no s'han determinat la seva naturalesa de longitud completa.[7]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048612 – Ensembl, May 2017
  2. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. Hum Mol Genet, 9, 2, Feb 2000, pàg. 217–26. DOI: 10.1093/hmg/9.2.217. PMID: 10607832.
  5. Genomics, 68, 3, Nov 2000, pàg. 313–21. DOI: 10.1006/geno.2000.6290. PMID: 10995573.
  6. J Biol Chem, 282, 42, Oct 2007, pàg. 30745–53. DOI: 10.1074/jbc.M704798200. PMID: 17702744 [Consulta: free].
  7. 7,0 7,1 «Entrez Gene: FER1L3 fer-1-like 3, myoferlin (C. elegans)».
  8. Harsini, Faraz M; Chebrolu, Sukanya; Fuson, Kerry L; White, Mark A; Rice, Anne M Scientific Reports, 8, 1, 19-07-2018, pàg. 10949. Bibcode: 2018NatSR...810949H. DOI: 10.1038/s41598-018-29184-1. PMC: 6053371. PMID: 30026467.
  9. Blomme, A; Costanza, B; de Tullio, P; Thiry, M; Van Simaeys, G Oncogene, 36, 15, abril 2017, pàg. 2116–2130. DOI: 10.1038/onc.2016.369. PMID: 27775075 [Consulta: free].

Bibliografia

  • «Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones.». DNA Res., 9, 3, 2003, pàg. 99–106. DOI: 10.1093/dnares/9.3.99. PMID: 12168954.
  • «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XV. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.». DNA Res., 6, 5, 2000, pàg. 337–45. DOI: 10.1093/dnares/6.5.337. PMID: 10574462.
  • «Directed proteomic analysis of the human nucleolus.». Curr. Biol., 12, 1, 2002, pàg. 1–11. DOI: 10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID: 11790298.
  • «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–903. Bibcode: 2002PNAS...9916899M. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
  • «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet., 36, 1, 2004, pàg. 40–5. DOI: 10.1038/ng1285. PMID: 14702039.
  • «The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10.». Nature, 429, 6990, 2004, pàg. 375–81. Bibcode: 2004Natur.429..375D. DOI: 10.1038/nature02462. PMID: 15164054.
  • «Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 101, 33, 2004, pàg. 12130–5. Bibcode: 2004PNAS..10112130B. DOI: 10.1073/pnas.0404720101. PMC: 514446. PMID: 15302935.
  • «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res., 14, 10B, 2004, pàg. 2121–7. DOI: 10.1101/gr.2596504. PMC: 528928. PMID: 15489334.
  • «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks.». Cell, 127, 3, 2006, pàg. 635–48. DOI: 10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID: 17081983.

Enllaços externs

  • «Gene and Cell Therapy Group».