Dicer |
---|
|
Estructures disponibles |
---|
PDB | Cerca ortòloga: PDBe RCSB |
---|
Llista de codis id de PDB |
---|
2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ |
|
|
Identificadors |
---|
Àlies | DICER1 (HUGO), DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW |
---|
Identif. externs | OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1 OMA: DICER1 - orthologs |
---|
Localització del gen (humà) |
---|
| Crom. | Cromosoma 14 (humà)[1] |
---|
| Banda | 14q32.13 | Inici | 95.086.228 bp[1] |
---|
Fi | 95.158.010 bp[1] |
---|
|
Localització del gen (ratolí) |
---|
| Crom. | Cromosoma 12 (ratolí)[2] |
---|
| Banda | 12 E|12 54.83 cM | Inici | 104.654.001 bp[2] |
---|
Fi | 104.718.211 bp[2] |
---|
|
Patró d'expressió d'ARN |
---|
Bgee | humà | ratolí (ortòleg) |
---|
Més explicacions | - tail of epididymis
- caput epididymis
- nervi òptic
- os esponjós
- corpus epididymis
- mucosa of paranasal sinus
- visceral pleura
- cavitat oral
- parietal pleura
- inferior ganglion of vagus nerve
|
| Més explicacions | - zigot
- secondary oocyte
- primary oocyte
- tail of embryo
- genital tubercle
- mandibular prominence
- medullary collecting duct
- corpuscle renal
- abdominal wall
- primitive streak
|
| Més referències a dades d'expressió |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Ontologia genètica |
---|
Funció molecular | - unió de nucleòtids
- helicase activity
- protein domain specific binding
- pre-miRNA binding
- metal ion binding
- endoribonuclease activity
- endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
- unió proteica
- siRNA binding
- RNA binding
- nuclease activity
- double-stranded RNA binding
- endonuclease activity
- activitat hidrolasa
- unió d'ATP
- ribonuclease III activity
- DNA binding
- deoxyribonuclease I activity
| Component cel·lular | - citoplasma
- citosol
- Complex de silenciament induït per ARN
- growth cone
- ARC complex
- RISC-loading complex
- axó
- dendrita
- nucli cel·lular
- endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment
- exosoma extracel·lular
| Procés biològic | - neuron projection morphogenesis
- RNA processing
- negative regulation of transcription by RNA polymerase II
- peripheral nervous system myelin formation
- pre-miRNA processing
- positive regulation of myelination
- nerve development
- RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
- positive regulation of Schwann cell differentiation
- negative regulation of Schwann cell proliferation
- production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
- miRNA metabolic process
- production of siRNA involved in RNA interference
- silenciament gènic
- apoptotic DNA fragmentation
- negative regulation of tumor necrosis factor production
- NIK/NF-kappaB signaling
- negative regulation of gene expression
- tube formation
| Fonts:Amigo / QuickGO |
|
Ortòlegs |
---|
Espècies | Humà | Ratolí |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (ARNm) | |
---|
NM_001195573 NM_001271282 NM_001291628 NM_030621 NM_177438 |
| |
---|
RefSeq (proteïna) | |
---|
NP_001182502 NP_001258211 NP_001278557 NP_085124 NP_803187 |
| |
---|
Localització (UCSC) | Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb | Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb |
---|
Cerca a PubMed | [3] | [4] |
---|
|
Wikidata |
Veure/Editar gen humà | Veure/Editar gen del ratolí |
|
Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip (siRNAs i miRNAs) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat.
El nom Dicer fou donat per Emily Bernstein, qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima.
Les enzimes Dicer contenen:
- un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal
- un domini DUF283 de funció desconeguda
- un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3'
- dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu
- un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal
Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA.
- ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100697 - Ensembl, May 2017
- ↑ 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 – Ensembl, May 2017
- ↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.