Coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu
![]() | Aquest article tracta sobre una espècie de coronavirus que inclou múltiples soques. Per a la varietat que causa SARS, vegeu SARS-CoV. Per a la varietat que causa COVID-19, vegeu SARS-CoV-2. |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus ![]() | |
---|---|
![]() ![]() | |
Enregistrament | |
![]() | |
Dades | |
Hoste | Vivèrrid, ésser humà i ratpenats ![]() |
Genoma | virus d'ARN monocatenari positiu, virus d'ARN monocatenari positiu i virus d'ARN monocatenari positiu ![]() |
Malaltia | infecció per coronavirus ![]() |
Taxonomia | |
Regne | Orthornavirae |
Fílum | Pisuviricota |
Classe | Pisoniviricetes |
Ordre | Nidovirales |
Família | Coronaviridae |
Gènere | Betacoronavirus |
Espècie | Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus ![]() |
Nomenclatura | |
Sinònims | Severe acute respiratory syndrome coronavirus ![]() |
Els coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu (SARSr-CoV) són una espècie de virus que infecta humans, ratpenats i altres mamífers. Es tracta de virus d'ARN monocatenari de sentit positiu amb embolcall que entren a la cèl·lula hoste en unir-se al receptor ACE2.[1] Pertanyen al gènere dels Betacoronavirus, de la subfamília Orthocoronavirinae (coronavirus), dins de la família Coronaviridae.[2]
Dues soques d'aquesta espècie han provocat brots de malalties respiratòries greus en humans: el SARS-CoV, que va causar un brot de síndrome respiratòria aguda severa (SARS) entre el 2002 i el 2003, i SARS-CoV-2, que des de finals del 2019 ha provocat una pandèmia per coronavirus (causant de la COVID-19).[3][4] A part de les dues mencionades anteriorment, hi ha centenars d'altres soques de SARSr-CoV, totes elles només conegudes per infectar espècies no humanes: els ratpenats són un reservori important de moltes soques de coronavirus relacionades amb el SARS, i s'han identificat diverses soques en civetes (Paradoxurus), que probablement foren els ancestres del SARS-CoV.[5][3]
Els coronavirus relacionats amb el SARS van ser uns dels diversos virus identificats per l'Organització Mundial de la Salut el 2016 com a probable causa d'una futura epidèmia en un nou pla desenvolupat després del brot d'Ebola a l'Àfrica de l'oest de 2014, per a recerca i desenvolupament d'urgència de proves de diagnòstic, vacunes i medicaments. La predicció va esdevenir un fet amb la pandèmia per coronavirus de 2019-2020.
Classificació
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/73/Coronavirus_virion.jpg/220px-Coronavirus_virion.jpg)
Els coronavirus relacionats amb el SARS (SARSr-CoV) pertanyen al gènere betacoronavirus (grup 2) i al subgènere Sarbecovirus (subgrup B).[6] Els sarbecovirus, a diferència dels embecovirus o els Alphacoronavirus, només tenen una proteïnasa similar a la papaïna (PLpro) en lloc de dues en el marc obert de lectura ORF1.[7] Els SARSr-CoV van ser determinats com una primera divisió dels betacoronavirus ja que tenen un conjunt de dominis conservats que comparteix amb el grup.[7][8]
Ordre Nidovirales
- Família Coronaviridae
- Subfamília Orthocoronavirinae (coronavirus)
- Gènere Betacoronavirus; espècie tipus: Murine coronavirus
- Subgènere Sarbecovirus
- Espècie Coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu (SARSr-CoV)[2]
- SARS-CoV (causant del SARS en humans)
- SARS-CoV-2 (causant de la COVID-19 en humans)
- Soca de rat-penat SL-CoV-WIV1
- Soca de rat-penat SARSr-CoV HKU3
- Soca de rat-penat SARSr-CoV RP3
- Espècie Coronavirus relacionats amb la síndrome respiratòria aguda greu (SARSr-CoV)[2]
- Subgènere Sarbecovirus
- Gènere Betacoronavirus; espècie tipus: Murine coronavirus
- Subfamília Orthocoronavirinae (coronavirus)
Reservori natural i zoonosi
Els ratpenats són el principal reservori hoste per als SARSr-CoV. El virus ha coevolucionat amb el seus hostes ratpenats durant un llarg període.[9]
Ha estat recentment quan les SARSr-CoV han evolucionat per fer la transmissió entre espècies (salt d'hoste) dels ratpenats als humans, com en el cas de les soques SARS-CoV i SARS-CoV-2.[10][11] Ambdues soques descendeixen d'un avant-passat comú, però van fer la zoonosi mitjançant espècies creuades cap als humans per separat i de formes diferents. El SARS-CoV-2 no és descendent directe de SARS-CoV.[5] El 17 de març de 2020, la comunitat científica van informar que el nou virus SARS-CoV-2 es va originar de manera natural, sense intervenció artificial (descartant així qualsevol hipòtesi de bioterrorisme), originari d'un coronavirus de ratpenat emprant com a hoste intermedi un pangolí.[12][13]
Referències
- ↑ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis» (en anglès). Viruses, 2, 8, 24-08-2010, pàg. 1804–1820. DOI: 10.3390/v2081803. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC3185738. PMID: 21994708.
- ↑ 2,0 2,1 «International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)» (en anglès). ICTV, 02-2019. [Consulta: 23 març 2020].
- ↑ 3,0 3,1
- ↑ Cohen, Jon; Kupferschmidt, Kai «Strategies shift as coronavirus pandemic looms» (en anglès). Science, 367, 6481, 28-02-2020, pàg. 962–963. DOI: 10.1126/science.367.6481.962. ISSN: 0036-8075.
- ↑ 5,0 5,1 Lau, S. K. P.; Li, K. S. M.; Huang, Y.; Shek, C.-T.; Tse, H. «Ecoepidemiology and Complete Genome Comparison of Different Strains of Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Rhinolophus Bat Coronavirus in China Reveal Bats as a Reservoir for Acute, Self-Limiting Infection That Allows Recombination Events» (en anglès). Journal of Virology, 84, 6, 15-03-2010, pàg. 2808–2819. DOI: 10.1128/JVI.02219-09. ISSN: 0022-538X.
- ↑ Wong, Antonio; Li, Xin; Lau, Susanna; Woo, Patrick «Global Epidemiology of Bat Coronaviruses» (en anglès). Viruses, 11, 2, 20-02-2019, pàg. 174. DOI: 10.3390/v11020174. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC6409556. PMID: 30791586.
- ↑ 7,0 7,1 Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung «Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis» (en anglès). Viruses, 2, 8, 24-08-2010, pàg. 1804–1820. DOI: 10.3390/v2081803. ISSN: 1999-4915. PMC: PMC3185738. PMID: 21994708.
- ↑ «Coronaviridae - Figures - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses» (en anglès). ICTV, 2011. Arxivat de l'original el 2020-01-16. [Consulta: 24 març 2020].
- ↑ Gouilh, Meriadeg Ar; Puechmaille, Sébastien J.; Gonzalez, Jean-Paul; Teeling, Emma; Kittayapong, Pattamaporn «SARS-Coronavirus ancestor’s foot-prints in South-East Asian bat colonies and the refuge theory» (en anglès). Infection, Genetics and Evolution, 11, 7, 01-10-2011, pàg. 1690–1702. DOI: 10.1016/j.meegid.2011.06.021. ISSN: 1567-1348.
- ↑ Cui, Jie; Han, Naijian; Streicker, Daniel; Li, Gang; Tang, Xianchun «Evolutionary Relationships between Bat Coronaviruses and Their Hosts - Volume 13, Number 10—October 2007 - Emerging Infectious Diseases journal - CDC» (en anglès). CDC - Emerging Infectious Diseases, 10-10-2017. DOI: 10.3201/eid1310.070448.
- ↑ Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian «Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor» (en anglès). Nature, 503, 7477, 2013-11, pàg. 535–538. DOI: 10.1038/nature12711. ISSN: 1476-4687.
- ↑ Andersen, Kristian G.; Rambaut, Andrew; Lipkin, W. Ian; Holmes, Edward C.; Garry, Robert F. «The proximal origin of SARS-CoV-2» (en anglès). Nature Medicine, 17-03-2020, pàg. 1–3. DOI: 10.1038/s41591-020-0820-9. ISSN: 1546-170X.
- ↑ Zhang, Tao; Wu, Qunfu; Zhang, Zhigang «Pangolin homology associated with 2019-nCoV» (en anglès). bioRxiv, 20-02-2020, pàg. 2020.02.19.950253. DOI: 10.1101/2020.02.19.950253.