CD1d

CD1d
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4MNG, 4MQ7, 4WW2
Identificadors
Àlies	CD1D (HUGO), CD1A, R3, R3G1, CD1d molecule
Identif. externs	OMIM: 188410   MGI: 107674   HomoloGene: 1337   GeneCards: CD1D   OMA: CD1D - orthologs
Localització del gen (humà) Crom. Cromosoma 1 (humà)[1] Banda 1q23.1 Inici 158.178.030 bp[1] Fi 158.186.427 bp[1]
Localització del gen (ratolí) Crom. Cromosoma 3 (ratolí)[2] Banda 3 F1|3 37.91 cM Inici 86.903.141 bp[2] Fi 86.906.748 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN Bgee Humà Ratolí (ortòleg) Més explicacions monòcit granulòcit tim melsa sang Gònada right lobe of liver  apèndix vermiforme jejunal mucosa  duodè Més explicacions teixit adipós blanc left lobe of liver  greix subcutani teixit adipós marró tunica adventitia of aorta  músculs intercostals body of femur  lactiferous gland  fossa Rostral migratory stream  Més dades d'expressió de referència BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular beta-2-microglobulin binding  lipopeptide binding  histone binding  endogenous lipid antigen binding  lipid antigen binding  exogenous lipid antigen binding  cell adhesion molecule binding  unió proteica  Component cel·lular citoplasma  component integral de la membrana  endosoma  membrana del reticle endoplasmàtic  membrana  integral component of plasma membrane  superfície cel·lular  lysosomal membrane  membrana plasmàtica basolateral  Lisosoma  endosome membrane  membrana plasmàtica  reticle endoplasmàtic  extracel·lular  external side of plasma membrane  Procés biològic procés del sistema immunitari  T cell selection  heterotypic cell-cell adhesion  positive regulation of T cell proliferation  detection of bacterium  positive regulation of innate immune response  antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib  sistema immunitari innat  procés viral  antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib  regulation of immune response  positive regulation of T cell mediated cytotoxicity  resposta immunitària  Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 912 12479 Ensembl ENSG00000158473 ENSMUSG00000028076 UniProt P15813 P11609 RefSeq (ARNm) NM_001766 NM_001319145 NM_001371761 NM_001371762 NM_001371763 NM_007639 NM_001379501 NM_001379502 NM_001379503 RefSeq (proteïna) NP_001306074 NP_001757 NP_001358690 NP_001358691 NP_001358692 NP_031665 NP_001366430 NP_001366431 NP_001366432 Localització (UCSC) Chr 1: 158.18 – 158.19 Mb Chr 3: 86.9 – 86.91 Mb Cerca a PubMed [3] [4]
Wikidata
Veure/Editar Humà Veure/Editar Ratolí

La molècula CD1d és un membre de la família de glicoproteïnes CD1 expressat en la superfície de diverses cèl·lules presentadores d'antígens humanes. Són similars a les MHC, tant pel que fa a la seva funció com la seva estructura. Podem classificar CD1 dins de MHC classe Ib. Però allò que les diferencia és que les CD1 no es troben codificades dins la regió cromosòmica de l'MHC i que presenten lípids i glicolípids en lloc de pèptids.

La CD1d, en presentar lípids, activen una classe especial de cèl·lules T conegudes com a cèl·lules citocides naturals. En activar-se produeixen ràpidament citocines, representades per la producció de l'interferó gamma i l'interleuquina-4.

La família de les CD1 humanes està formada per cinc proteïnes glicosidades: CD1a, CD1b, CD1c, CD1d, CD1e que tenen polimorfisme limitat.

Les molècules CD1 es classifiquen en dos grups:

• Grup 1: format per CD1a, CD1b i CD1c
• Grup 2: representat per CD1d.

Hi ha estudis que inclouen CD1e (forma intermèdia que s'expressa intracel·lularment) dins del primer grup, però d'altres el deixen com un grup a part. Les molècules del Grup 1 presenten antígens lipídics exògens, ja que ancoren les cadenes apolars del lligand al seu lloc d'unió hidròfob. A més, exposen el grup majoritari del lligand a la superfície de la cadena pesada de les CD1, que pot ser reconegut pel TCR. Les del Grup 2 presenten antígens lipídics propis mitjançant el mateix mecanisme que les del grup 1. Als ratolins els manca el grup 1 de les molècules de CD1 i, al seu torn, tenen dues còpies de les CD1d.

Les molècules de CD1 no són polimòrfiques, però constitueixen una família de gens diferents. Als éssers humans, el locus CD1 conté 5 gens: cadascun dels 5 subtipus de CD1. Es troben a la regió q22-23 del cromosoma 1 (formant un clúster) i ocupen 190kb en total.

Les molècules CD1 s'expressen en :

• Cd1a : als timòcits doble i simples positius, als limfòcits T madurs de sang perifèrica activats A i a les cèl·lules de Langerhans.
• Cd1c: en una subpoblació determinada de limfòcits B. A les cèl·lules dendrítiques (quan migren de l'epidermis cap al gangli limfàtic regional) i als limfòcits T madurs de sang perifèrica activats
• Cd1b: A les cèl·lules dendrítiques (quan migren de l'epidermis cap al gangli limfàtic regional) i als limfòcits T madurs de sang perifèrica activats
• Les molècules de CD1d s ‘expressen, a baixos nivells, al timus i al citoplasma de la majoria de les cèl·lules epitelials de l'intestí prim i gros. S'expressa constitutivament en monòcits, macròfags i DC en molts estadis de maduració (les altres isomorfes necessiten activació). Les molècules de CD1e es localitzen a l'aparell de Golgi de les cèl·lules dendrítiques immadures i als lisosomes de les madures. No s'expressa a la superfície cel·lular, cosa que exclou la interacció directa amb els limfòcits T.

Les proteïnes CD1 intervenen en la presentació d'antígens lipídics a limfòcits T. És el complex format pel lípid i la molècula el que serà reconegut pel receptor de l'antigen del limfòcit T, i no tan sola la molècula, com en altres casos. La presentació per part de CD1 d'antígens lipídics sol provocar una resposta immune de les CD1-restricted T cells.

CD1 és un heterodímer compost per una cadena pesada (45 kDa) que s'associa amb la cadena lleugera (12 kDa). Zona extracel·lular: tres dominis d'aproximadament 90 residus cadascun, anomenat α1, α2, α3 units per ponts intercatenaris.

Els dominis α1 i α2 constitueixen regions de contingut variable en aminoàcids (constitueixen la variabilitat de la molècula). Aquests dos dominis es combinen i formen la zona d'interacció amb l'antigen. Una de les parets del forat, està formada per una hèlix α i l'altra paret, per una altra hèlix α. La base de la fossa està constituïda per 8 làmines β plegades (cada domini aporta 4). El domini α3 és bastant constant, pertany al domini de les Ig i mostra homologia amb la β-2-immunoglobulina. El canal d'unió està format per aminoàcids neutres o hidròfobs. Això permet allotjar molècules amfipàtiques amb els residus polars que sobresurten de la ranura i estan en contacte amb els TCR. Aquest lloc d'unió és diferent en els diversos tipus de CD1, així pot presentar diferents lípids antigènics:­

• Els llocs d'unió de CD1a i CD1d estan compostos per dues grans butxaques que formen dos túnels. Aquestes s'anomenen A' i F' utilitzant la terminologia introduïda per a l'estructura de mCD1d.
• El de CD1b té tres butxaques (anomenades A', F' i C') més un túnel que les connecta (T'). Té d'un portal de sortida per la butxaca C' que permet encabir cadenes hidrocarbonades llargues. És el subtipus de CD1 que permet unir molècules més grans.
• CD1e quasi no té d'aminoàcids carregats a l'hèlix α1. És probable que això faciliti la interacció amb els seus lligands dins de les membranes.
• L'hèlix α-1 de mCD1d1 de ratolí adopta una conformació irregular i extensa. El mCD1d2 té 17 possibles conformacions, sis de les quals es troben al lloc d'unió.

• El CD1d també és conegut com a R3G1